本产品是一种通过高特异性的Anti-V5磁珠进行V5标签融合蛋白免疫沉淀或免疫共沉淀的试剂盒。本产品的免疫沉淀产物,可以用于V5标签融合蛋白或其蛋白复合物组分的检测。
本试剂盒包含高质量的Anti-V5磁珠及经过优化验证的免疫沉淀必要试剂,使免疫沉淀(IP,也称Pull-down)或免疫共沉淀(Co-IP)实验更加简单、便捷、高效,广泛用于带有V5标签的融合蛋白或其蛋白复合物的免疫沉淀、免疫共沉淀或纯化等实验。
本试剂盒包含高质量的BalbMag Anti-V5 Magnetic Beads (Anti-V5磁珠)、BalbMag Mouse IgG Magnetic Beads (小鼠IgG磁珠,作为阴性对照)及优化的各种缓冲液如Lysis Buffer、10×TBS、100×Protease Inhibitor Cocktail、25×V5 Peptide、Acid Elution Buffer、Neutralization Buffer、5×SDS-PAGE Sample Loading Buffer等免疫沉淀必要试剂,使免疫沉淀或免疫共沉淀实验更加简单、便捷、高效。
免疫沉淀或免疫共沉淀是研究蛋白或蛋白与蛋白相互作用(PPIs)的常用实验技术,通过使用特异性抗体和可结合抗体的介质(如Protein A/G Agarose或Protein A/G磁珠),或直接使用偶联特异性抗体的介质(如琼脂糖凝胶或磁珠),然后通过离心或磁力从溶液中分离出抗原和抗体复合物,从而将目标蛋白质从复杂样品中分离出来,随后可以用于Western印迹检测或质谱分析等。
V5标签(V5-tag)、Flag标签(Flag-tag)、Myc标签(Myc-tag)、HA标签(HA-tag)、His标签(His-tag)和GST标签(GST-tag)等是表达载体上最常见的一些标签,通过与这些标签的融合表达可以非常方便地检测目的蛋白及与目的蛋白相互结合的蛋白,也可以非常方便地用于目的蛋白的纯化。
V5-tag是从猴副流感病毒V5中分离得到的由14个氨基酸(GKPIPNPLLGLDST)组成的多肽,通过基因重组技术把V5-tag的核酸序列与目的基因的5'端或3'端连接,就可以最终表达形成V5-tag的目的蛋白。V5-tag具有以下优点:V5-tag通常不会与目的蛋白相互作用,并且大多数情况下不会影响目的蛋白的功能;V5-tag作为蛋白标签,后续通过V5抗体、Anti-V5磁珠(货号:YTB4314)或Anti-V5亲和凝胶(货号:YTB4331)即可对目的基因的表达、定位及功能进行检测或对目的蛋白进行纯化、免疫沉淀或免疫共沉淀等。基于以上优点,V5标签已被广泛应用于蛋白表达、纯化、鉴定、相互作用和功能等多方面的研究。
本试剂盒进行免疫沉淀的流程参考图1。
图1.百奥莱博V5标签蛋白免疫沉淀试剂盒(磁珠法)的免疫沉淀流程图。
本试剂盒中的Anti-V5磁珠可以特异性地结合V5标签融合蛋白,并可以借助磁力架等磁分离设备非常便捷地应用于带有V5标签的融合蛋白或其蛋白复合物的免疫沉淀或纯化等实验。
- Anti-V5磁珠的特点:
- 特异性强、靶蛋白结合量高:与国内外大多数的同类产品相比,本Anti-V5磁珠抗体结合密度高,对带有V5标签蛋白的结合具有很强的特异性,并且磁珠粒径小,不易产生非特异吸附。每mL磁珠悬浊液含约10mg磁珠,含有不少于0.6mg V5抗体,通常可结合不少于0.6mg V5标签融合蛋白,具体的最大结合量和标签蛋白的分子量大小等相关。每500μL样品,通常仅需使用10~20μL磁珠悬浊液,就可以高效地进行免疫沉淀实验。
- 可结合多种形式的V5标签蛋白:Anti-V5磁珠可特异性地结合N端V5融合蛋白(V5-Protein)、C端V5融合蛋白(Protein-V5)。
- 结合目的蛋白速度快:Anti-V5磁珠为纳米级磁珠(~200nm),具有超大的比表面积,便于抗体和抗原的快速有效结合。通常10分钟内即可完成抗原吸附的过程,30分钟内完成目的蛋白免疫沉淀操作。缩短操作时间可以有效避免在长时间操作过程中目的蛋白的降解或变性,充分保证目的蛋白的活性。
- 特异性强、靶蛋白结合量高:与国内外大多数的同类产品相比,本Anti-V5磁珠抗体结合密度高,对带有V5标签蛋白的结合具有很强的特异性,并且磁珠粒径小,不易产生非特异吸附。每mL磁珠悬浊液含约10mg磁珠,含有不少于0.6mg V5抗体,通常可结合不少于0.6mg V5标签融合蛋白,具体的最大结合量和标签蛋白的分子量大小等相关。每500μL样品,通常仅需使用10~20μL磁珠悬浊液,就可以高效地进行免疫沉淀实验。
- Anti-V5磁珠的主要指标:
磁珠浓度 10mg/mL 磁珠粒径 ~200nm 磁珠磁性 超顺磁性 偶联抗体 小鼠抗V5单抗 抗体类型 IgG1 抗体分子量 约150kDa 抗体浓度 ≥0.6mg/mL磁珠 结合能力 ≥0.6mg V5标签蛋白/mL磁珠 特异性 V5-Protein 洗脱方法 SDS-PAGE上样缓冲液洗脱法;
V5多肽竞争洗脱法;
酸性洗脱法。应用 IP、Co-IP、蛋白纯化
本试剂盒提供三种洗脱方法。根据目的蛋白的结构、生物学功能及后续应用的要求等,本试剂盒提供三种洗脱方法,包括V5多肽、酸性和SDS-PAGE上样缓冲液洗脱液进行洗脱。特别是V5多肽洗脱后不会包含抗体的轻链和重链,可以有效解决免疫沉淀后Western实验中轻链和重链的干扰问题。Anti-V5磁珠用于V5融合蛋白的免疫沉淀效果参考图2。
图2.百奥莱博的磁珠法免疫沉淀试剂盒(V5标签蛋白)用于V5融合蛋白的免疫沉淀效果图。293T细胞(人胚肾细胞)转染V5融合蛋白质粒36小时后,经Lysis Buffer裂解。样品1为Input,即全细胞裂解液;样品2为小鼠IgG磁珠免疫沉淀后经1×SDS-PAGE Sample Loading Buffer洗脱后的样品,该Mouse IgG是正常的小鼠IgG,为阴性对照;样品3为本试剂盒中Anti-V5磁珠免疫沉淀后的样品,并使用1×SDS-PAGE Sample Loading Buffer洗脱。实际结果会因实验条件、检测仪器等的不同而存在差异,图中数据仅供参考。
组分 | 100T | 500T |
Lysis Buffer | 50mL | 250mL |
10×TBS | 5mL | 15mL |
100×Protease Inhibitor Cocktail | 0.5mL | 2.5mL |
BalbMag Anti-V5 Magnetic Beads | 0.4mL | 2mL |
BalbMag Mouse IgG Magnetic Beads | 80μL | 0.4mL |
25×V5 Peptide | 80μL | 0.4mL |
Acid Elution Buffer | 2mL | 10mL |
Neutralization Buffer | 0.2mL | 1mL |
5×SDS-PAGE Sample Loading Buffer | 0.4mL | 2mL |
保存:-20℃,有效期一年。BalbMag Anti-V5 Magnetic Beads和BalbMag Mouse IgG Magnetic Beads可以4℃保存。
对于常规的免疫沉淀实验,按照每100μL样品使用4μL磁珠悬浊液,本试剂盒小包装和中包装分别可以进行100次和500次样品的免疫沉淀,同时分别可以进行20个和100个阴性对照的免疫沉淀;按照每500μL样品使用20μL磁珠悬浊液,则分别可以进行20次和100次样品的免疫沉淀,同时分别可以进行4个和20个阴性对照的免疫沉淀。
- 需自备磁分离架。
- 如果免疫沉淀的目的蛋白涉及磷酸化修饰或者乙酰化修饰,需要自备相应的磷酸酶抑制剂和去乙酰化酶抑制剂。推荐选购百奥莱博的磷酸酶抑制剂混合物A (50X,货号:YT970L)和去乙酰化酶抑制剂混合物(100X,货号:YTB4030)。
- 本试剂盒提供的Lysis Buffer经反复测试,适合很多情况下的免疫沉淀或免疫共沉淀时的样品裂解和后续的洗涤。但由于免疫沉淀或免疫共沉淀蛋白样品的复杂性和特殊性,本Lysis Buffer不一定适合所有免疫沉淀样品的裂解与洗涤。在使用本试剂盒提供的Lysis Buffer效果欠佳的情况下,需要自行对于裂解液和洗涤液进行摸索和调整。此时建议根据文献自行配制裂解液和洗涤液,或尝试百奥莱博的其它适当裂解液。
- BalbMag系列磁珠经测试,反复冻融3次以上,不影响使用效果。
- BalbMag Magnetic Beads需维持pH为6~8,避免高速离心、干燥或冻存;请勿长时间将磁珠置于磁场中,否则可能会引起磁珠聚团。
- BalbMag Magnetic Beads使用前要适当充分重悬,即颠倒若干次使磁珠混合均匀,混匀操作须轻柔,不宜剧烈涡旋震荡等,避免抗体变性等。
- 在免疫沉淀时,建议设置阳性和阴性对照组(BalbMag Mouse IgG Magnetic Beads)。本试剂盒中提供适量的阴性对照,更多需求,可以订购百奥莱博的小鼠IgG磁珠(货号:YTB4361)。
- 蛋白样品收集后宜尽快完成纯化工作,并应始终放置在4℃或冰浴,以减缓蛋白降解或变性。
- 如果使用真空泵等仪器吸取上清液,须注意真空泵的吸液强度,以免吸力过大而吸取到聚集的磁珠。
- 酸性溶液洗脱时磁珠可能会发生聚集,属于正常现象,不影响磁珠的正常使用。0.1%的非离子型去垢剂(如Triton X-100、Tween-20或NP-40)可有效防止磁珠聚集,并且不会影响磁珠的抗体结合效率。
- 试剂盒的准备:
- 参考下表,按照每个样品使用100~500μL裂解液的比例,准备相关试剂。
Steps Solution required Volume per assay Volume per assay Cell lysis and sample preparation Lysis Buffer with Protease Inhibitor Cocktail 100μL 500μL Preparation of V5 Peptide elution buffer and magnetic beads TBS ~0.52mL ~1.6mL Immunoprecipitation Magnetic Beads 4μL 20μL Wash (3 times) Lysis Buffer with Protease Inhibitor Cocktail 100μL each time 500μL each time Peptide competitive elution (optional) 1×Peptide solution 20μL 100μL Acid elution and neutralization (optional) Acid Elution Buffer 20μL 100μL Neutralization Buffer 2μL 10μL SDS-PAGE sample loading buffer elution (optional) 1×SDS-PAGE Sample Loading Buffer 20μL 100μL - 含抑制剂裂解液的配制:参考上表,按照每50~100万细胞使用100~200μL含抑制剂裂解液用于裂解以及300~600μL含抑制剂裂解液用于洗涤的比例,配制适量的含抑制剂裂解液。将Lysis Buffer与100×Protease Inhibitor Cocktail按照100:1的比例混合,例如在1mL的Lysis Buffer中加入10μL 100×Protease Inhibitor Cocktail,即得1mL含抑制剂裂解液(Lysis Buffer with Protease Inhibitor Cocktail)。配制好的含抑制剂裂解液宜放置在冰浴或4℃。
注1:如果免疫沉淀的目的蛋白涉及磷酸化修饰或者乙酰化修饰,需要添加磷酸酶抑制剂或去乙酰化酶抑制剂。推荐使用百奥莱博的磷酸酶抑制剂混合物L(货号:YT970L)和去乙酰化酶抑制剂混合物(货号:YTB4030)。如果有特殊需求,可考虑选择其它适当的抑制剂混合物。
注2:本试剂盒提供的Lysis Buffer不仅用于样品裂解,也用于后续的洗涤步骤,请特别注意“注意事项”中的相关描述。
注3:含抑制剂裂解液宜现用现配,不宜配制后冻存并留作后续使用。如果有特殊需求,可以尝试百奥莱博的其它多种蛋白酶、磷酸酶和去乙酰化酶抑制剂混合物。 - TBS的配制:将10×TBS用超纯水水稀释至1X,即为TBS。例如1mL 10×TBS加入9mL超纯水,混匀后即为TBS。
- 磁珠的准备:由于磁珠储存在特殊保护液中,所以需要在加入样品前适当洗涤。
① 用移液器轻轻吹打重悬磁珠,按照每500μL样品使用20μL磁珠悬浊液比例,取适量磁珠至一洁净离心管中(货号:YTB8001),加入TBS至最终体积为约0.5mL。说明:如果初始磁珠体积大于0.2mL,可以考虑先直接置于磁力架上分离10秒,去除上清,然后再加入TBS至最终体积为约0.5mL。
② 用移液器轻轻吹打重悬磁珠。置于磁力架上分离10秒,去除上清。重复上述步骤两次。
③ 按照初始体积的量,用TBS重悬磁珠。 - V5多肽洗脱液的配制:将25×V5 Peptide用TBS稀释25倍即为3X V5多肽洗脱液,如将10μL 25×V5 Peptide加入240μL TBS中混匀即可。配制好的V5多肽洗脱液宜放置在冰浴或4℃。本25×V5 Peptide经过优化,适用于大多数洗脱,如果标签蛋白丰度高,也可以仅稀释10倍。如需更多的V5多肽,可订购百奥莱博的V5 Peptide (货号:YTB1294)。
- 1×SDS-PAGE Sample Loading Buffer的配制:取适量5×SDS-PAGE Sample Loading Buffer用水稀释5倍即为1×SDS-PAGE Sample Loading Buffer。例如0.2mL 5×SDS-PAGE Sample Loading Buffer加入0.8mL超纯水,混匀后即为1×SDS-PAGE Sample Loading Buffer。
- 参考下表,按照每个样品使用100~500μL裂解液的比例,准备相关试剂。
- 细胞或组织样品的裂解和准备:
样品裂解后宜立即进行后续的免疫沉淀或免疫共沉淀,如果不能立即进行后续的实验,可以-20℃或-80℃冻存,但冻融可能会影响蛋白与蛋白的相互作用。所有的样品裂解步骤宜在冰浴或4℃操作,以尽量减少蛋白降解的可能性。样品准备好后,注意取一定量作为Input或Total,以用于后续的Western等检测。- 悬浮细胞的样品裂解和准备:
250~1000×g室温离心3~5min收集细胞。如有必要,可以使用PBS洗涤一次,然后吸净残留的液体。轻轻vortex或者弹击管底以把细胞尽量分散开。按照每50~100万细胞加入100~200μL的比例加入含抑制剂裂解液。轻弹管底或适当吹打,以充分裂解细胞。充分裂解后应没有明显的细胞沉淀。如果细胞量较多,建议分装成50~100万细胞/管,然后再裂解。大团的细胞较难裂解充分,而少量的细胞由于裂解液容易和细胞充分接触,相对比较容易裂解充分。充分裂解后,10000~14000×g在4℃离心3~5分钟,取上清,即可进行后续的免疫沉淀和免疫共沉淀等。
注:裂解后会出现少量不溶性物质,主要为基因组DNA等,离心后会产生沉淀物。 - 贴壁细胞样品的裂解和准备:
吸除培养液。如有必要,用PBS洗涤一次,然后吸净残留的液体。按照每50~100万细胞(相当于6孔板的一个孔)加入100~200μL的含抑制剂裂解液,适当吹打,使裂解液和细胞充分接触。通常裂解液接触动物细胞1~2秒后,细胞就会被裂解。植物细胞宜在冰上裂解2~10min。充分裂解后,10000~14000×g在4℃离心3~5分钟,取上清,即可进行后续的免疫沉淀和免疫共沉淀等。
注:裂解后会出现少量不溶性物质,主要为基因组DNA等,离心后会产生沉淀物。 - 细菌或酵母样品的裂解和准备:
对于1mL菌液或酵母液,离心去上清,如果有必要,可以使用PBS洗涤一次,然后吸净残留的液体。轻轻vortex或者弹击管底以把细菌或酵母尽量分散开。加入100~200μL含抑制剂裂解液,轻轻vortex或者弹击管底以混匀,冰上裂解2~10min。如果希望获得更好的裂解效果,细菌和酵母可以分别使用溶菌酶(lysozyme)和破壁酶(lyticase)消化,然后再使用含抑制剂裂解液进行裂解。充分裂解后,10000~14000×g在4℃离心3~5分钟,取上清,即可进行后续的免疫沉淀和免疫共沉淀等。
注:裂解后很可能会出现少量不溶性物质,主要为基因组DNA等,离心后会产生沉淀物。 - 组织样品的裂解和准备:
① 把组织剪切成细小的碎片。如果组织样品本身非常细小,也可以不再进行剪切。
② 按照每10~20mg组织使用100~200μL的比例加入含抑制剂裂解液。如果裂解不充分可以使用更多的含抑制剂裂解液,如果需要高浓度的蛋白样品,可以适当减少裂解液的用量。
③ 用玻璃匀浆器匀浆,或使用手持式组织研磨仪研磨,直至充分裂解。也可以把组织样品冷冻后液氮研磨,研磨充分后加入裂解与洗涤液进行裂解。
④ 充分裂解后,10000~14000×g在4℃离心3~5分钟,取上清,即可进行后续的免疫沉淀和免疫共沉淀等。每20mg冻存的小鼠肝脏组织用200μL含抑制剂裂解液裂解后获得的上清,其蛋白浓度约为15~25mg/ml,不同状态的不同组织有所不同。
注:裂解后很可能会出现少量不溶性物质,主要为基因组DNA等,离心后会产生沉淀物。
- 悬浮细胞的样品裂解和准备:
- 免疫沉淀(IP):
- 加入磁珠与孵育:按照每500μL蛋白样品加入20μL磁珠悬浊液的比例加入磁珠,置于侧摆摇床或旋转混合仪上,室温孵育2小时或4℃孵育过夜。
注1:样品中需要加入BalbMag Anti-V5 Magnetic Beads用于免疫沉淀带有V5标签的目的蛋白及其复合物,同时建议酌情在部分样品中加入BalbMag Mouse IgG Magnetic Beads进行免疫沉淀以作为阴性对照。
注2:孵育过程中,如果磁珠发生聚团或呈片状属正常现象,不会影响实验结果。
注3:对于使用BalbMag Anti-V5 Magnetic Beads进行免疫沉淀后续发现背景非常高的情况,可以考虑使用BalbMag Mouse IgG Magnetic Beads进行预沉淀处理,以消除非特异性吸附,然后再使用BalbMag Anti-V5 Magnetic Beads进行免疫沉淀。BalbMag Mouse IgG Magnetic Beads用于进行预免疫沉淀时用量比较多,需要另行订购。 - 磁分离:孵育完毕后,置于磁力架上分离10秒,去除上清。
注:可保留部分上清液,用于检测免疫沉淀的效果。 - 洗涤:加入0.5mL的含抑制剂裂解液,用移液器轻轻吹打重悬磁珠。置于磁力架上分离10秒,去除上清。重复使用含抑制剂裂解液洗涤三次。
注:也可以通过检测洗涤得到的液体的OD280来判断是否洗涤完全,若OD280大于0.05,应适当增加洗涤次数。
- 加入磁珠与孵育:按照每500μL蛋白样品加入20μL磁珠悬浊液的比例加入磁珠,置于侧摆摇床或旋转混合仪上,室温孵育2小时或4℃孵育过夜。
- 洗脱:
根据标签蛋白的特点及后续实验要求,可以选择如下3种方法之一进行洗脱。- V5多肽竞争洗脱法:
本方法为非变性法,洗脱效率高,且洗脱后的蛋白保持原有的生物活性,便于后续分析检测。
① 每20μL原始磁珠体积,加入100μL V5多肽洗脱液,混匀后置于侧摆摇床或旋转混合仪上,室温摇晃孵育30~60分钟,或4℃孵育1~2小时。为了提高洗脱效率,可延长孵育时间或重复洗脱。
② 孵育完毕后,置于磁力架上分离10秒,将上清转移到新的离心管中。上清即为洗脱的V5标签蛋白及其复合物。
③ 洗脱的V5标签蛋白及其复合物置于4℃待用,或者-20℃或-80℃长期保存。
注:由于V5-tag与V5抗体的结合力非常强,V5多肽竞争洗脱的效果可能会不太理想,此时需要对V5多肽浓度及竞争条件进行一定的优化。 - 酸性洗脱法:
本方法为非变性法,比较快速高效。洗脱后的蛋白很多情况下能保持原有的生物活性,便于后续分析检测。
① 每20μL原始磁珠体积,加入100μL Acid Elution Buffer (酸性洗脱液),混匀后置于侧摆摇床或旋转混合仪上,室温孵育5分钟。
注:孵育时间不宜超过15分钟。
② 孵育完毕后,置于磁力架上分离10秒,将上清转移到新的离心管中,并立刻加入10μL Neutralization Buffer (中和液),适当混匀。
注:须立刻加入中和液并混匀,否则长时间处于酸性洗脱液中会容易导致一些蛋白失去活性。
③ 为了获得最大的洗脱效率,可重复步骤①和②,并将相同样品合并。
④ 洗脱并中和的V5标签蛋白及其复合物置于4℃待用,或者-20℃或-80℃长期保存。
注1:酸性洗脱法虽然高效,但仍可能低于竞争洗脱法或SDS-PAGE上样缓冲液洗脱法。
注2:由于目的蛋白的差异可能对酸性洗脱法的洗脱效率有一定的影响,如果对洗脱效率的要求比较高,可对酸性洗脱液的pH在2.5~3.1之间进行一定的调整,相应的中和液的pH值或量也要进行一定的调整,具体需要自行优化相关实验条件。也可以考虑采用效率预期最高的SDS-PAGE上样缓冲液洗脱法,后者的缺点是在变性条件下进行洗脱,可能会对后续的对于蛋白活性有要求的实验产生影响。 - SDS-PAGE上样缓冲液洗脱法:
本方法为变性法,得到的蛋白样品适合SDS-PAGE电泳或Western检测。
① 每20μL原始磁珠体积的磁珠,加入100μL 1×SDS-PAGE Sample Loading Buffer,95℃加热5分钟。
② 置于磁力架上分离10秒,取上清即可用于SDS-PAGE电泳或Western检测。
注1:通常SDS-PAGE蛋白上样缓冲液含有DTT等还原剂,其洗脱得到的蛋白样品中会含有抗体的轻链和重链。
注2:其它SDS-PAGE上样缓冲液可以考虑选择百奥莱博的SDS-PAGE蛋白上样缓冲液(2×,货号:YT051)、SDS-PAGE蛋白上样缓冲液(5×,货号:YT620)、SDS-PAGE蛋白上样缓冲液(6×,货号:YT052)。
- V5多肽竞争洗脱法:
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